Gregory est compté parmi les fervents soutiens d’Isaac Newton, il est le premier dont les élèves sont versés dans les nouvelles théories de Newton. Son influence permet à ces théories d’être répandu en Écosse avant même d’atteindre une large acceptation en Angleterre. Il soutient aussi Newton dans sa controverse avec Leibniz sur la paternité du calcul infinitésimal.